А можно апгрейдить военные здания, когда в них тренируются юниты? Эти юниты не исчезнут?

нет...апгрейт мона начать только когда в здании никто не тренируетца

А когда можно улучшить площадку медитации?

http://ds.rambler.ru/?p=186&type=military
смотришь улучшенную площадку и каккие уровни наук необходимы и сколько ресов должно быть в наличии и людей для апгрейта...
как только все это будет так сразу и можно будет...на закладке информация у здания появитца кнопка улучшить

А можно такую же ссылочку только для вора))

Пожалуста полжуетесь http://ds.rambler.ru/?p=185&type=military