Подозреваю, что 65535 байтов- максимальный размер для такого файла
(подозрение не основано на знаниях флеша, только на общем знакомстве с компьютерами).
Если ограничение действительно в заморочках флеша, то лечится это созданием пары таких файлов
(и скока же надо таких армий для такого большого списка координат?)
